GB/T 38481-2020.Determination of ultralow-frequency mutations for microorganisms-Duplex sequencing.
1范圍
GB/T 38481規(guī)定了用雙重測(cè)序法測(cè)定微生物超低頻突變的方法。
GB/T 38481適用于微生物基因組或基因片段超低頻突變的測(cè)定。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其較新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T 6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件。
3.1
超低頻突變 ultralow-frequency mutations
化學(xué)、物理或生物因素導(dǎo)致微生物DNA發(fā)生的頻率低于1X 10-的永久性改變。
3.2
條形碼標(biāo)簽 barcode label
接在待測(cè)DNA片段兩側(cè)的核苷酸片段,用以標(biāo)示同一擴(kuò)增家族的DNA.協(xié)助進(jìn)行突變位點(diǎn)的確認(rèn)。
3.3
互補(bǔ)標(biāo)簽家族 complementary tag family
所有含兩端互補(bǔ)條形碼標(biāo)簽的DNA片段。
3.4
雙鏈同源序列 double-strand consensus sequences;DCSs
帶有相同條形碼標(biāo)簽的雙鏈DNA序列,包含反向互補(bǔ)鏈。
4原理
在待測(cè)DNA片段兩端接上一段12 nt隨機(jī)且互補(bǔ)的雙鏈核苷酸條形碼標(biāo)簽,然后對(duì)所有帶有條形碼標(biāo)簽的序列進(jìn)行雙重的高通量測(cè)序。利用12 nt隨機(jī)互補(bǔ)標(biāo)簽,排除掉測(cè)序文庫(kù)制備過(guò)程中所引入的突變,進(jìn)而準(zhǔn)確檢測(cè)突變位點(diǎn)和突變率。
5試劑
除非另有規(guī)定,僅使用分析純?cè)噭?br />5.1 水。GB/T 6682,一級(jí)。
檢測(cè)流程步驟
溫馨提示:以上內(nèi)容僅供參考使用,更多檢測(cè)需求請(qǐng)咨詢客服。